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如何選擇正確的方法進行細胞的支原體檢測?支原體的檢測方法有哪些?目前實驗室常用的支原體檢測方法有培養法、熒光指示細胞法、PCR法、掃描電子顯微鏡法,這些方法各有優缺點。各實驗室可根據具體情況,選擇不同的方法,或幾種方法聯合使用。一、培養法培
如何選擇正確的方法進行細胞的支原體檢測?支原體的檢測方法有哪些?目前實驗室常用的支原體檢測方法有培養法、熒光指示細胞法、PCR 法、掃描電子顯微鏡法,這些方法各有優缺點。各實驗室可根據具體情況,選擇不同的方法,或幾種方法聯合使用。
一、培養法
培養法為最為經濟可靠的方法,但其實驗周期較長,所以常用來進行對懷疑細胞的最后甄別。常用于細胞及臨床治療細胞的支原體檢查。
(一)材料與設備
1. 精氨酸肉湯培養基 按說明稱量粉劑,蒸餾水配制, 高壓除菌(加20%胎牛血清)。2. 支原體瓊脂培養基 按說明稱量粉劑,蒸餾水配制,高壓除菌(加20%胎牛血清)。3. 其他 超凈工作臺、無菌吸管、試管架、培養試管/皿、37°C 培養箱。
(二)操作步驟
1. 樣品的儲存。樣品取材后,最好盡快進行檢測。樣品如在24h 以內進行支原體檢測, 可儲存在2~8℃; 如果超過24h 樣品應放置于-20℃ 以下保存。-20℃保存的樣品,進行檢測時需重新加入到對照培養細胞中,培養72h 后,取上清直接進行接種檢測。2. 準備精氨酸肉湯培養基、支原體瓊脂培養基(半流體)。3. 將樣品分別接種到10ml 精氨酸肉湯培養基、半流體培養基中(已冷卻至36℃) ,每支培養基接種樣品0.5~ 1.0ml. 每種樣品接種6 支精氨酸肉湯培養基,3 支半流體培養基。4. 接種6d 后,取3 支精氨酸肉湯培養基中樣品0.5 ~ 1.0ml. 復種于精氨酸肉湯培養基中。5. 36 ℃ 培養29d, 每隔3d 觀察一次。記錄實驗結果。
(三)結果判斷
培養結束時,精氨酸肉湯培養基如有支原體生長,則液體顏色改變(粉色或黃色) 。半流體培養基中如有支原體生長,則出現絮狀沉淀
二、熒光指示細胞法
熒光指示細胞法較為快捷,方法簡單,但其靈敏度有一定的欠缺, 易造成漏檢。
常見的支原體檢測方法中最簡單、最經濟的方法是熒光指示細胞法。該方法使用的熒光染料是煙酸己可堿,其激發波長為350nm(紫外激發),發射波長為420nm。該染料會結合到DNA 中富含A-T 的區域,由于支原體的DNA中A-T 含量占多數(55%~80%),所以可被染色而檢測到。支原體污染的細胞經染色后,在細胞核外與細胞周圍可看到許多大小均一的熒光小點,即為支原體DNA, 證明該細胞有支原體污染。
(一)材料與設備
1. 熒光顯微鏡。2. CO2 培養箱。3. 無菌小爬片。4. 無菌培養皿。5. 不含抗生素的完全培養液。6. 二苯甲酰胺熒光染料濃縮液(50μg/ml) 。稱取5mg 二苯甲酰胺熒光染料加入100ml 不含酚紅和碳酸氫鈉的Hanks 平衡鹽溶液中,在室溫下用磁力攪拌30~40min, 使完全溶解,-20℃ 避光保存。7. 二苯甲酰胺熒光染料工作液(0.5μg/ml) 。取1ml 上述濃縮液,加至100ml 無酚紅和碳酸氫鈉的Hanks 溶液中,終濃度為0.5μg/ml 。8. 固定液,即乙酸:甲醇(1 : 3) 溶液為細胞固定液。9. 封片液。0.1mol/L枸櫞酸22.2ml, 0.2mol/L Na2HPO4·12H2O 27.8ml, 丙三醇50.0ml,以上三者混勻,調pH 至5.5 。10.不含酚紅和碳酸氫鈉的Hanks 平衡鹽溶液或PBS。經多種方法檢測確定為支原體陰性的VERO 細胞。
(二)操作步驟1. 無菌收集待測細胞上清:懸浮細胞離心后取上清液。2. VERO 細胞爬片:將小爬片無菌置于小培養皿內,滴加VERO 細胞懸液(細胞濃度約3×104 個/ml) 2~3ml, 置于CO2 培養箱內培養24h 使其貼壁。3. 制備標本。向6 孔板內滴加待檢細胞上清液約1ml, 注意設立對照組(已證實的支原體陽性和陰性細胞上清液),培養48h 后( VERO 細胞匯合前)將細胞爬片從平皿中取出。4. 漂洗—將細胞爬片置于培養皿中,用不含酚紅、NaHCO3 的Hanks 溶液(或PBS) 漂洗3次。5. 固定—用乙酸:甲醇(1 : 3) 固定液固定 10 min 。6. 漂洗—待固定液自然風干后用去離子水漂洗3 次。7. 染色—置于Hoechst 33258 工作液(0.5μg/ml) 中染色10 min 。8. 漂洗—去離子水中漂洗3 次,每次1 ~2min 。9. 封片,紫外激發,觀察。
(三)結果判斷當陰性及陽性對照結果均成立時,結果有效 。1. 陰性結果 僅見待檢細胞的細胞核呈現藍色熒光。2. 陽性結果 熒光顯微鏡下細胞周圍或細胞膜表面可見大小不等、不規則的藍色熒光小點和絲狀點。
(四)小結1. 嚴格配制工作液及封片液。2. 保證作為指示細胞的VERO 細胞沒有被支原體污染。3. 必須同時設立陽性及陰性對照, 注意重復,以排除假陽性和假陰性結果。4. 應全面觀察爬片,并注意可疑陽性的熒光點是凋亡小體還是支原體污染。5. 可適當調整熒光染料的工作濃度和染色時間,避免出現非特異性染色,如胞漿著色。
三、PCR 法
PCR 法檢測支原體的方法最為快速、靈敏、取樣量少,既可做細胞本身,也可做細胞上清的檢測,同時可以檢測多種支原體的污染,是目前常用的檢測手段。但其成本較高,條件要求嚴格,且有時易出現假陽性或假陰性。彌補的方法是對懷疑的樣品要經過3 次PCR 檢測,或用培養法檢測。
PCR 法是20 世紀80 年代中期建立起來的一種體外DNA 擴增實驗,其基本原理是酶促DNA 合成反應,即在DNA 模板、引物和脫氧核糖核酸存在下,經DNA 聚合酶的作用,使DNA 鏈擴增延伸。該實驗具有靈敏度高、特異性強、檢測快速的特點,但其對實驗環境要求嚴格, 實驗成本較高, 有時還會出現假陽性的現象。
(一)材料與設備支原體
PCR 檢測試劑盒、dNTP 、TaqDNA 聚合酶、緩沖溶液、瓊脂糖、礦物油、超凈工作臺、PCR 儀、電泳儀、凝膠成像分析系統、臺式離心機、旋渦混旋器等。
(二)操作步驟
1. 樣品的收集。待測細胞用無雙抗培養液培養7d,用無菌容器取上清液500μl ,4℃ 保存待測。2. 模板的制作。在無菌的條件下, 取細胞培養上清1 00μl 于一無菌的0.5ml塑料離心管內,蓋好蓋子, 95 ℃ 水浴加熱5min 。3. 打開蓋子,向管內加StrataClean Resin 10μl,蓋好蓋子,旋渦混懸器混合,離心5~ 10s, 吸取上清至一新的塑料離心管中,模板制作完畢, 4℃ 保存。4. PCR 反應。反應體系的最適條件為10mmol/L Tris-HCI (pH 8.38), 50 mmol/L KCI, 1.5~ 2.5 mmol/L MgCl2,200 μmol/L dNTP, 2U Taq DNA 聚合酶,總反應體系為50μl , 反應用去離子水均需用紫外燈照射。(1)在0.5ml 塑料離心管中加入35.2μl 去離子水及5μl 10 xTaq 反應緩沖溶液。(2)依次加入下列成分:0.4μl dNTP (25mmol/L)、0.4μl Taq 酶(5U/μl ) 、2μl引物。(3)加2μl 去離子水,總體積45μl 。(4)加5μl 已制成的模板到反應體系中。(5)陽性對照,內對照各5μl 加入到各自的反應體系中。(6)取1支含有以上反應體系的離心管,加入5μl 去離子水作為陰性對照管。(7)在反應體系中加入100μl 礦物油。(8)PCR 程序見下表。
5. 瓊脂糖凝膠電泳。PCR 反應結束后,進行瓊脂糖凝膠電泳,瓊脂糖凝膠濃度為2%。電泳結束后,凝膠成像分析結果。6. 結果分析。該方法為檢測支原體的定性方法,在電泳泳道上, Marker、陽性對照、內對照均會出現不同的電泳條帶, 當被檢樣品泳道出現明亮條帶,且位置在陽性對照和內對照條帶位置之間,即可認為該樣品被支原體污染 。有時還會發現一條泳道出現多條,可能是該樣品感染2 種以上支原體所致。如果泳道內條帶隱約出現,則可懷疑有支原體污染,重做該樣品。
(三)注意事項PCR 反應的前期操作應在無菌環境中進行。注意假陽性、假陰性,有時需多次重復。
四、掃描電子顯微鏡法
掃描電子顯微鏡法:掃描電子顯微鏡法非常直觀、準確,對使用環境要求高,操作復雜,實驗周期較長,常作為樣品的最后定性檢測。
(一)原理
利用電子顯微鏡的超級放大功能, 直接觀察培養細胞中支原體污染情況。
(二)材料與設備
待檢測細胞, 0.05%胰蛋白酶/0.02%EDTA 、2.5%的戊二酸、1%鋨酸、0.1mol/L磷酸緩沖溶液( pH7.4 ) ,掃描電鏡及相關設備。
( 三)操作步驟
1. 將待檢測細胞傳代至貼有蓋玻片的培養皿中。2. 37°C , CO2 培養箱中培養24h , 取出蓋玻片。3. 以PBS 洗滌3 次。4 . 以2 .5%戊二醛/PBS 固定15min , PBS 洗滌。5 .以1%鋨酸固定30min, PBS 洗滌。6 . 乙酸異戊酯脫水。7. CO2 冰點干燥。8. 噴金。9 . 掃描電鏡觀察,照相。
(四)結果分析
支原體感染會使培養細胞慢慢枯萎,因此對培養細胞定期進行支原體檢測非常重要。一般來說每1至3個月就應該進行一次支原體檢測。將定期支原體檢測常規化堅持下去,是細胞培養實驗室應對支原體感染的關鍵。
作者:海星生物公眾號:Cas9X細胞基因敲除以上內容由海星生物(http://www.cas9x.com)提供服務內容:CRISPR/Cas9細胞基因編輯 載體構建/病毒包裝 PDO/動物模型CDX 穩轉細胞株 干細胞/原代細胞 培養試劑盒
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